普罗亭 普罗亭
单细胞测序服务
快速进行单细胞的标记、建库、测序和分析,高效获得上万个单细胞的基因表达谱。
技术原理 技术特点 应用方向 服务流程 样本要求 样本类型 数据分析 服务成果
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技术原理
10X Genomics 单细胞转录组测序平台利用微流控和 barcode 标记等技术,捕获近十万个细胞,从而获得大量的转录组信息。该过程通量高、成本低、周期短。
技术特点
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通量高 一次测序,同时可检测8个通道,每个通道一次可捕获10000个细胞,一次实验可分选标记80000个细胞

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周期短 完成上万个细胞封装仅需6分钟内,完成单细胞悬液、细胞捕获、扩增以及建库仅需1天

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精度高 真正意义上实现对单个细胞的测序,每一个细胞形成单独的GEMs

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CyTOF的样本要求有什么? 单个细胞捕获效率高达65%

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范围广 可以广泛应用于个体异质性、免疫微环境、神经科学、胚胎发育、细胞分化等领域的研究

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类型多 细胞类型多样化,对细胞大小要求低(适宜40 μm直径以内),无下限

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应用方向
服务流程
普罗亭采用多对一的项目合作模式,针对单个项目建立包含多名专业技术人员的专项团队。
深入了解客户需求,从合同签订到结项报告全流程有效沟通并严格质控。提供更加专业、放心的质谱流式完整解决方案。
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样本要求
  • 样品类型
    样品类型
    新鲜人或小鼠细胞悬液、血液 (全血、PBMC等)
  • 细胞总数
    细胞总数
    细胞悬液,一个样本细胞起 始量约2.0x105个。
  • 质量要求
    质量要求
    细胞活性大于85%,理想浓 度约为1000个/ul
  • 培养需求
    培养需求
    细胞培养基及缓冲液不能含有Ca2+和Mg2+等影响酶活性的物质
样本类型
人源样本包括肝癌、肺癌、胃癌等癌组织和斑块、血管、 皮肤等非癌组织。
小鼠样本包括小肠癌、直肠癌、黑色素瘤等癌组织和脑膜,心脏、骨髓等非癌组织。
涉及实体瘤、血液病、自身免疫病、心血管疾病、呼吸系统疾病等多个领域,每年检测量超10000例。
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人源样本
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小鼠样本
数据分析
普罗亭生信分析团队的核心科学家博士毕业于美国拥有顶级生物医学工程专业 的佐治亚理工学院,核心算法的系列
软件均为自主研发,拥有正式授权的软件著作权35项。能够为客户提供定制化的数据挖掘方案,满足多样化的数据分析挖掘需求。
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UMAP
降维可视化展示不同cluster、group细胞以及marker表达的空间分布
Frequency bar
展示不同group间不同cluster细胞数量的占比
correlation
展示细胞群之间的相关性
Violin plot
展示基因在各个样本中的表达情况
dotplot
统计学分析出不同group间差异的细胞表型
Volcano plot
展示基因的差异表达情况
3D Pseudotime
拟时序分析细胞群体发育轨迹
Pseudotime
预测细胞的分化及发育轨迹
GO/KEGG Enrichment
系统分析基因产物在细胞中的代谢途径及其功能
Interaction network map
差异基因蛋白网络互作分析
heatmap
展示亚群cluster与其marker表达模式
01
02
03
04
05
06
07
08
09
10
11
服务成果
文献60篇,累计IF=912,平均15,10分以上达50%
  • 合作单位
    发表文章
    发表期刊
    IF
    发表时间
  • 香港中文大学理工学院深圳综合科学与技术研究院
    High-dimensional single-cell cartography tracking of immune cells subpopulation of mice peripheral blood treated with gold nanorods and black phosphorus nanosheets
    Nano Today
    18.962
    2022-11
  • 浙江大学附属第二医院
    The epidermal immune microenvironment plays a dominant role in psoriasis development, as revealed by mass cytometry
    Cell Mol Immunol.
    22.096
    2022-11
  • 浙江大学附属第一医院
    Immune-infiltrating signature based classification reveals CD103+CD39+ T cells associate with colorectal cancer prognosis and response to immunotherapy
    Front Immunol.
    8.786
    2022-10
  • 浙江大学附属第一医院
    Comprehensive immune cell analysis of human menstrual-blood-derived stem cells therapy to concanavalin A hepatitis
    Front Immunol.
    8.786
    2022-09
  • 杭州市第一人民医院
    Prediction of tumor recurrence by distinct immunoprofiles in liver transplant patients based on mass cytometry
    "Am J Cancer Res ."
    5.942
    2022-09
  • 北京协和医院
    Single-cell profiling identifies mechanisms of inflammatory heterogeneity in chronic rhinosinusitis
    Nat Immunol
    31.250
    2022-09
  • 浙江大学附属第一医院
    Mass cytometry-based peripheral blood analysis as a novel tool for early detection of solid tumours: a multicentre study
    Gut
    31.793
    2022-09
  • 浙江大学附属第二医院
    High-dimensional Single-cell Analysis Delineates Peripheral Immune Signature of Coronary Atherosclerosis in Human Blood
    Theranostics
    11.600
    2022-09
  • 郑州大学第二附属医院
    Case report: Single-cell mapping of peripheral blood mononuclear cells from a patient with both Crohn's disease and isolated congenital asplenia
    Front Immunol.
    8.786
    2022-09
  • 北京协和医院
    Single-Cell Profiling of the Immune Atlas of Tumor-Infiltrating Lymphocytes in Endometrial Carcinoma
    Cancers (Basel).
    6.575
    2022-09
  • 复旦大学附属中山医院
    Peripheral naïve CD8+ T cells as a predictive biomarker of response to lenvatinib plus an anti-PD-1 antibody in advanced hepatocellular carcinoma: a biomarker study
    Cancer Commun(Lond)
    15.283
    2022-08
  • 浙江大学附属第一医院
    Decoding the single-cell landscape and intercellular crosstalk in the transplanted liver: a 4-dimension mouse model
    Transplantation
    5.385
    2022-07
  • 浙江大学
    Metal-Chelatable Porphyrinic Frameworks for Single-Cell Multiplexing with Mass Cytometry
    Angew Chem Int Ed Engl.
    16.823
    2022-07
  • 广州呼吸健康研究院
    Immunoassay and mass cytometry revealed immunological profiles induced by inactivated BBIBP COVID-19 vaccine
    J Med Virol.
    20.693
    2022-07
  • 武汉大学口腔医学院
    Single-cell analysis reveals immune cellular components in odontogenic keratocysts
    Oral Dis
    4.068
    2022-06
  • 南京大学附属鼓楼医院
    Mass cytometry reveals immune atlas of urothelial carcinoma
    BMC cancer
    4.638
    2022-06
  • 浙江大学附属第一医院
    Dynamic Immune Landscape and VZV-Specific T Cell Responses in Patients With Herpes Zoster and Postherpetic Neuralgia
    Frontiers in Immunolog
    8.786
    2022-06
  • 山东大学
    Targeting tissue-resident memory CD8 + T cells in the kidney is a potential therapeutic strategy to ameliorate podocyte injury and glomerulosclerosis
    Molecular therapy
    12.910
    2022-05
  • 华西医院
    Integrating single-cell RNA sequencing with spatial transcriptomics reveals immune landscape for interstitial cystitis
    Signal Transduct Target Ther.
    38.104
    2022-05
  • 复旦大学肿瘤医院
    Hypoxia-reprogrammed regulatory group 2 innate lymphoid cells promote immunosuppression in pancreatic cancer
    eBioMedicine
    11.205
    2022-04
  • 复旦大学附属中山医院
    Interferon-α potentiates anti-PD-1 efficacy by remodeling glucose metabolism in the hepatocellular carcinoma microenvironment
    Cancer Discovery
    38.272
    2022-04
  • 北京大学人民医院
    Lung adenocarcinoma manifesting as subsolid nodule potentially represents tumor in the equilibrium phase of immunoediting
    Immunology
    7.251
    2022-03
  • 浙江大学附属第一医院
    Dynamic profiling of immune microenvironment during pancreatic cancer development suggests early intervention and combination strategy of immunotherapy
    eBioMedicine
    11.205
    2022-03
  • 浙江大学附属第一医院
    Combination cancer immunotherapy targeting TNFR2 and PD-1/PD-L1 signaling reduces immunosuppressive effects in the microenvironment of pancreatic tumors
    Journal for ImmunoTherapy of Cancer
    12.469
    2022-03
  • 浙江大学附属邵逸夫医院
    Systemic and single cell level responses to 1 nm size biomaterials demonstrate distinct biological effects revealed by multi-omics atlas
    Bioactive materials
    16.874
    2022-03
  • 复旦大学附属中山医院
    PKCα/ZFP64/CSF1 axis resets the tumor microenvironment and fuels anti-PD1 resistance in hepatocellular carcinoma
    Journal of hepatology
    30.083
    2022-02
  • 浙江大学附属第二医院
    Specific immune status in Parkinson's disease at different ages of onset
    npj Parkinson's Disease
    9.304
    2022-01
  • 浙江大学附属第一医院
    Single-Cell immune signature for detecting early-stage HCC and early assessing anti-PD-1 immunotherapy efficacy
    Journal for ImmunoTherapy of Cancer
    12.469
    2022-01
  • 中南大学湘雅医院
    Engineering an enthesis-like graft for rotator cuff repair: An approach to fabricate highly biomimetic scaffold capable of zone-specifically releasing stem cell differentiation inducers
    Bioactive materials
    16.874
    2022-01
  • 深圳市第三人民医院
    Discovery of CD3+CD19+ cells, a novel lymphocyte subset with a potential role in human immunodeficiency virus-Mycobacterium tuberculosis coinfection, using mass cytometry
    Clinical and translational medicine
    8.554
    2021-12
  • 浙江大学
    Rational administration sequencing of immunochemotherapy elicits powerful anti-tumor effect
    Journal of Controlled Release
    11.467
    2021-12
  • 长海医院
    An Immune Atlas of Nephrolithiasis: Single-Cell Mass Cytometryon SIRT3 Knockout and Calcium Oxalate-Induced Renal Injury
    Journal of Immunology Research
    4.493
    2021-11
  • 复旦大学附属中山医院
    A cellular census of human peripheral immune cells identifies novel cell states in lung diseases
    Clinical and translational medicine
    8.554
    2021-11
  • 南方医科大学珠江医院
    Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Heterogeneity of Tumor-Associated Macrophage in Non-Small Cell Lung Cancer and Differences Between Sexes
    Frontiers in Immunolog
    8.786
    2021-11
  • 浙江大学
    Pro-Inflammatory Signature in Decidua of Recurrent Pregnancy Loss Regardless of Embryonic Chromosomal Abnormalities
    Frontiers in Immunolog
    8.786
    2021-11
  • 复旦大学附属瑞金医院
    Distinct immune signatures discriminate between asymptomatic and presymptomatic SARS-CoV-2 pos subjects
    Cell Research
    46.297
    2021-11
  • 河南省肿瘤医院
    Toxic Epidermal Necrolysis-Like Reaction Following Combination Therapy With Camrelizumab and Apatinib for Advanced Gallbladder Carcinoma
    Frontiers in oncology
    5.738
    2021-10
  • 华西医院
    Short Chain Fatty Acids Prevent Glyoxylate-Induced Calcium Oxalate Stones by GPR43-Dependent Immunomodulatory Mechanism
    Frontiers in Immunolog
    8.786
    2021-10
  • 复旦大学附属华山医院
    Distinct human Langerhans cell subsets orchestrate reciprocal functions and require different developmental regulation
    Immunity
    43.747
    2021-10
  • 南方医科大学珠江医院
    The Effect of Smoking on the Immune Microenvironment and Immunogenicity and Its Relationship With the Prognosis of Immune Checkpoint Inhibitors in Non-small Cell Lung Cancer
    Frontiers in cell and developmental biology
    6.081
    2021-09
  • ‎中国西安第四军医大学
    GDF15 induces immunosuppression via CD48 on regulatory T cells in hepatocellular carcinoma
    Journal for immunotherapy of cancer
    12.469
    2021-09
  • 浙江大学附属邵逸夫医院
    Estrogen inhibits the growth of colon cancer in mice through reversing extracellular vesicle-mediated immunosuppressive tumor microenvironment
    Cancer Letters
    9.756
    2021-08
  • 浙江大学附属第二医院
    Fresh tissue multi-omics profiling reveals immune classification and suggests immunotherapy candidates of conwentional chondrosarcoma
    clinical cancer research
    13.801
    2021-08
  • 浙江大学
    GdClean: removal of Gadolinium contamination in mass cytometry data
    Bioinformatics
    6.931
    2021-07
  • 广东省人民医院
    DAGM: A novel modelling framework to assess the risk of HER2-negative breast cancer based on germline rare coding mutations
    EBioMedicine
    11.205
    2021-07
  • 浙江大学
    Mass cytometry and transcriptomic profiling reveal body-wide pathology induced by Loxl1 deficiency
    Cell Prolification
    8.755
    2021-06
  • 南方医科大学珠江医院
    Single-Cell Profiling of Kidney Transplant Recipients With Immunosuppressive Treatment Reveals the Dynamic Immune Characteristics
    Frontiers in Immunolog
    8.786
    2021-04
  • 浙江大学附属第一医院
    Group-2 Innate Lymphoid Cells Promote Hepatocellular Carcinoma Progression via CXCL2-Neutrophil Induced Immunosuppression
    Hepatology
    17.298
    2021-04
  • 医学科学院&中国民族大学
    Microglial deletion and inhibition alleviate behavior of post-traumatic stress disorder in mice
    Journal of neuroinflammation
    9.587
    2021-01
  • 浙江大学附属第一医院
    Mesenchymal stem cell-mediated immunomodulation of recruited mononuclear phagocytes during acute lung injury: a high-dimensional analysis study
    Theranostics
    11.600
    2021-01
  • 复旦大学附属瑞金医院
    Soluble PD-L1 improved direct ARDS by reducing monocyte-derived macrophages
    Cell Death & Disease
    9.685
    2020-10
  • 浙江大学附属第一医院
    Mesenchymal stem cells alleviate LPS-induced acute lung injury by inhibiting the proinflammatory function of Ly6C + CD8 + T cells
    Cell Death & Disease
    9.685
    2020-10
  • 复旦大学附属中山医院
    Global Immunometabolic Profiling of AECOPD
    Small Methods
    15.367
    2020-10
  • 浙江大学附属邵逸夫医院
    BxPC-3-Derived Small Extracellular Vesicles Induce FOXP3+ Treg through ATM-AMPK-Sirtuins-Mediated FOXOs Nuclear Translocations
    iScience
    6.107
    2020-08
  • 浙江大学附属第一医院
    Potent Anti-Tumor Activity of Bcma CAR-T Therapy Against Heavily Treated Multiple Myeloma and Dynamics of Immune Cell Subsets Using Single-Cell Mass Cytometry
    Blood (poster)
    25.476
    2019-11
  • 浙江大学附属第一医院
    Integrated multiomic analysis reveals comprehensive tumour hetero-geneity and novel immunophenotypic classification in hepatocellular carcinomas
    Gut
    31.793
    2019-11
  • 南京大学
    Role of CXCR3 signaling in response to anti-PD-1 therap
    EBioMedicine
    11.205
    2019-10
  • 浙江大学
    Single-cell mass cytometry reveals in vivo immunological response to surgical biomaterials
    Applied Materials Today
    8.663
    2019-09
  • 浙江大学附属第一医院
    Immunomodulatory effect of mesenchymal stem cells in chemical-induced liver injury:a high-dimensional analysis
    Stem Cell Research & Therapy
    8.079
    2019-08
  • 美国耶鲁大学
    Fibrinogen-like Protein 1 Is a Major Immune Inhibitory Ligand of LAG-3
    Cell
    66.850
    2019-01
香港中文大学理工学院深圳综合科学与技术研究院香港中文大学理工学院深圳综合科学与技术研究院
中国航天员中心中国航天员中心
北京生命科学研究所北京生命科学研究所
中国科学院生物物理研究所中国科学院生物物理研究所
浙江大学浙江大学
中山大学中山大学
复旦大学复旦大学
上海交通大学上海交通大学
中国人民解放军军事科学院军事医学研究院中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
北京大学北京大学
中国医学科学院血液病医院中国医学科学院血液病医院
苏州大学附属第一医院苏州大学附属第一医院
中国医学科学院皮肤病医院中国医学科学院皮肤病医院
浙江省人民医院浙江省人民医院
浙大妇产科医院浙大妇产科医院
浙大儿院浙大儿院
郑州大学第一附属医院郑州大学第一附属医院
深圳市人民医院深圳市人民医院
北京大学深圳医院北京大学深圳医院
广州市第一人民医院广州市第一人民医院
广东省中医院广东省中医院
广州市妇女儿童医疗中心广州市妇女儿童医疗中心
中山大学肿瘤防治中心中山大学肿瘤防治中心
上海市公共卫生临床中心上海市公共卫生临床中心
上海市红房子妇产科医院上海市红房子妇产科医院
上海市肺科医院上海市肺科医院
上海市第一人民医院上海市第一人民医院
北大肿瘤医院北大肿瘤医院
北京协和医院北京协和医院
华西医院华西医院
中国医学科学院肿瘤研究所中国医学科学院肿瘤研究所
瑞金医院瑞金医院
中山医院中山医院
华山医院华山医院
浙大一院浙大一院
浙大二院浙大二院
中山一院中山一院
北医三院北医三院
湘雅医院湘雅医院
同济医院同济医院
仁济医院仁济医院
西京医院西京医院
北大人民医院北大人民医院
湘雅二院湘雅二院
复旦大学附属肿瘤医院复旦大学附属肿瘤医院
301医院301医院
鲁南制药鲁南制药
君实生物君实生物
西湖生物西湖生物
强生强生
恒瑞医药恒瑞医药
微芯生物微芯生物
亘喜生物亘喜生物
天境生物天境生物
艾德生物艾德生物
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